ニキビの初期段階で、毛穴周辺に皮脂がたまり、毛穴がふさがった状態。主にターンオーバーの乱れや皮脂の過剰分泌によって起こります。その結果、毛穴が詰まり、毛穴から分泌される皮脂と反応して面皰（コメド）ができます。アクネ菌は皮脂を好み酸素を嫌うため、発育に好都合な面皰の中で増殖します。

白ニキビの皮脂が増えすぎることで毛穴が開き、表面にある白いコメドが空気に触れて酸化し、黒っぽく変化した状態。放置しておくと炎症を起こし、赤ニキビにつながってしまいます。

白ニキビや黒ニキビが悪化し、毛穴に溜った皮脂を栄養分としてアクネ菌が増殖し、炎症を起こす物質をつくります。炎症が起こるとニキビは赤く盛り上がった状態になり、押すと軽度の痛みを感じます。

赤ニキビの炎症が激しくなり、毛穴の中に膿が溜っている状態。皮膚の奥まで炎症を起こしていることが多く、クレーターなどのニキビ跡になるおそれがあります。

さらに炎症が拡大して進行すると、毛穴の壁が破壊され、皮下に膿のふくろができて「膿腫」となったり、硬く盛り上がって「硬結」ができます。強い炎症後には、凸凹したニキビ跡（瘢痕）を残すことがあります。

色素沈着はニキビの炎症によって発生したメラニンが原因で起こる、茶色いシミのようなニキビ跡です。ニキビができた部分は肌のターンオーバーが乱れて古い角質が残り、メラニンも分解・排除されないままになるため、色素が沈着してニキビ跡になってしまいます。

ニキビの炎症がひどくなると、毛穴や周辺組織を破壊し始めます。すると免疫反応によって炎症が広範囲にならないように白血球が皮膚細胞を破壊して炎症の広がりを抑えようとします。これが真皮層で起こることで肌が完全には修復されずへこみ、ニキビ跡がクレーター状態になってしまいます。